Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC10Q9NYD6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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