Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMPD3Q9NY59 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD3Q9NY59 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms