Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms