Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED17Q9NVC6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms