Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms