Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMC4Q9NTJ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms