Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PDS5BQ9NTI5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PDS5BQ9NTI5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms