Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS4Q9NRS4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS4Q9NRS4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms