Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBQLN4Q9NRR5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBQLN4Q9NRR5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBQLN4Q9NRR5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms