Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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