Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13B-203ENST00000488766 2671 ntTSL 519.66■□□□□ 0.741e-9■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC183-208ENST00000609471 644 ntTSL 219.66■□□□□ 0.742e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CPSF2-202ENST00000553427 715 ntTSL 419.64■□□□□ 0.732e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC22-203ENST00000496651 809 ntTSL 319.44■□□□□ 0.72e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.72e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC43-204ENST00000588687 721 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KIF3C-206ENST00000488341 875 ntTSL 319.08■□□□□ 0.642e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TUBB6-209ENST00000590693 524 ntTSL 418.99■□□□□ 0.632e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.622e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.628e-7■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DMTN-208ENST00000517418 977 ntTSL 218.91■□□□□ 0.622e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HOMER3-208ENST00000595756 570 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC9-202ENST00000392191 737 ntTSL 318.84■□□□□ 0.612e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DMTN-222ENST00000523623 581 ntTSL 318.8■□□□□ 0.62e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.592e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-208ENST00000417090 556 ntTSL 418.63■□□□□ 0.572e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-216ENST00000570232 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.39■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GCDH-212ENST00000590530 1871 ntTSL 218.39■□□□□ 0.538e-7■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-207ENST00000562701 816 ntTSL 1 (best)18.37■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DMTN-213ENST00000519850 587 ntTSL 418.34■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM129-205ENST00000480360 761 ntTSL 318.31■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.512e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-205ENST00000419280 1212 ntTSL 518.16■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.52e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ABCA7-219ENST00000612569 876 ntTSL 318.1■□□□□ 0.495e-15■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf43-205ENST00000448720 1616 ntTSL 218.03■□□□□ 0.482e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AP000487.1-201ENST00000530690 554 ntTSL 418.01■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-215ENST00000458655 565 ntTSL 418■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GCDH-203ENST00000585420 1730 ntTSL 217.95■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DHRS4-AS1-202ENST00000553454 1492 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DMTN-216ENST00000520174 1057 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13B-204ENST00000493506 2465 ntTSL 217.84■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-207ENST00000497251 715 ntTSL 217.83■□□□□ 0.442e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DMTN-210ENST00000517804 813 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DMTN-221ENST00000523300 601 ntTSL 417.14■□□□□ 0.332e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ACSF2-225ENST00000570356 380 ntTSL 516.9■□□□□ 0.32e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC1-206ENST00000588300 1055 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC183-204ENST00000479371 1786 ntTSL 1 (best)16.81■□□□□ 0.282e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf43-204ENST00000419841 1500 ntTSL 216.78■□□□□ 0.282e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ABCC1-207ENST00000575422 1198 ntTSL 516.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC183-202ENST00000371682 1437 ntTSL 516.73■□□□□ 0.272e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM44-214ENST00000494894 859 ntTSL 316.67■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-33■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-213ENST00000496347 995 ntTSL 316.64■□□□□ 0.252e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13B-202ENST00000487527 3023 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 AP003071.5-202ENST00000641280 500 nt16.5■□□□□ 0.232e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MGAT4D-207ENST00000515121 810 ntTSL 516.49■□□□□ 0.232e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.211e-9■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-207ENST00000581546 1237 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.22e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 KPTN-207ENST00000600271 743 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC1-209ENST00000589214 674 ntTSL 316.26■□□□□ 0.192e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 LAMB2-210ENST00000483057 558 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 STRN4-224ENST00000602397 631 ntTSL 316.19■□□□□ 0.182e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-9■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SCRN2-203ENST00000578323 624 ntTSL 516.05■□□□□ 0.162e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SGSH-213ENST00000575282 5562 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ZNRF1-210ENST00000568844 5331 nt16.01■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC1-207ENST00000575639 561 ntTSL 215.99■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC1-214ENST00000592083 938 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 SULT4A1-203ENST00000432404 2239 ntTSL 515.95■□□□□ 0.142e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf43-202ENST00000394035 1255 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.132e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.134e-8■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 MYO18B-209ENST00000540454 1099 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.122e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 STAT3-212ENST00000588065 571 ntTSL 415.82■□□□□ 0.122e-12■■■■■ 298.1
UTP3Q9NQZ2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-12■■■■■ 298.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 396 ms