Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCRT2Q9NQ03 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms