Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNB1IP1Q9NPC3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms