Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPHS2Q9NP85 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms