Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms