Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms