Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F12Q9HCS2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms