Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms