Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELL3Q9HB65 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELL3Q9HB65 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms