Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
UPF2Q9HAU5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPF2Q9HAU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms