Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRDE2Q9H7Z3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRDE2Q9H7Z3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms