Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A3Q9H7F0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms