Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD3Q9H7E2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms