Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF3Q9H094 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
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