Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2OQ9C0C9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2OQ9C0C9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms