Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SETD2Q9BYW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SETD2Q9BYW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms