Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIFKQ9BYG3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms