Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUSAP1Q9BXS6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms