Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TINF2Q9BSI4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TINF2Q9BSI4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms