Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPKQ9BS16 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPKQ9BS16 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPKQ9BS16 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPKQ9BS16 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPKQ9BS16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPKQ9BS16 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms