Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS3Q9BRX5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms