Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPATA25Q9BR10 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPATA25Q9BR10 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms