Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms