Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms