Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms