Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GAL3ST1Q99999 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GAL3ST1Q99999 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms