Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRG3Q99928 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRG3Q99928 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRG3Q99928 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms