Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC1Q96RQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCC1Q96RQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms