Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms