Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMTK3Q96Q04 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms