Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCZQ96LD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCZQ96LD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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