Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD4Q96KN9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms