Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK5

HIST1H2AH, Histone H2A type 1-H, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AHQ96KK5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIST1H2AHQ96KK5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIST1H2AHQ96KK5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms