Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNFT2Q96EX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNFT2Q96EX2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms