Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELP4Q96EB1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms