Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD4Q96DM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms