Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL29Q96CT2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms