Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTPBP3Q969Y2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTPBP3Q969Y2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms