Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRIM63Q969Q1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRIM63Q969Q1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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