Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1MTQ969P6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms